概要

TransDecoderプログラムはORFs予測とアミノ酸配列への翻訳を実行する。

使用例

入力ファイルin.fa.gzに対し、予測されたアミノ酸配列をin.transdecoder.pepファイルに出力する。

$ TransDecoder.LongOrfs -t in.fa.gz  # コード領域を探索
$ TransDecoder.Predict -t in.fa.gz   # コード領域を選択